Pemaju utama Assassin's Creed Shadows telah mengesahkan bahawa pemain tidak akan terlepas kandungan penting dengan memberi tumpuan kepada protagonis tunggal. Assassin's Creed Shadows menawarkan pemain pilihan antara dua watak yang menarik: Naoe, seorang shinobi wanita, dan Yasuke, samurai Afrika bersejarah-pilihan yang telah menghasilkan perbincangan pra-pelancaran yang cukup besar.
Sesetengah peminat bimbang bahawa memihak kepada satu watak mungkin membawa kepada titik plot utama yang hilang atau permainan. Pengarah Kreatif Jonathan Dumont menangani kebimbangan ini, menggambarkan pendekatan seimbangnya sendiri: "Saya cenderung beralih antara watak-watak yang sama rata. Sebagai contoh, saya mungkin menghabiskan 3-5 jam dengan satu protagonis, kemudian beralih dan bermain lagi 2-3 jam dengan yang kedua."
Walau bagaimanapun, Dumont meyakinkan pemain bahawa memilih watak utama tidak akan menghalang pengalaman mereka dengan ketara. Walaupun setiap protagonis mempunyai urutan pengenalan yang unik dan jalan cerita peribadi, naratif permainan ini menyesuaikan diri dengan keutamaan pemain. Dia menggalakkan pemain untuk bermain seperti yang mereka kehendaki: "Saya tidak percaya anda akan terlepas banyak, ia benar -benar datang ke playstyle peribadi anda. Anda mungkin berfikir, 'Baiklah, saya akan melihat bagaimana permainan menyesuaikan berdasarkan watak yang saya pilih.' Setiap wira mempunyai perkenalan unik dan questlines yang berdedikasi, tetapi pengalaman teras adalah fleksibel.
