De hoofdontwikkelaar van Assassin's Creed Shadows heeft bevestigd dat spelers geen cruciale inhoud zullen missen door zich te concentreren op een enkele hoofdrolspeler. Assassin's Creed Shadows biedt spelers een keuze tussen twee meeslepende personages: NAOE, een vrouwelijke shinobi en Yasuke, een historische Afrikaanse samurai-een keuze die een aanzienlijke pre-launch-discussie heeft gegenereerd.
Sommige fans waren bang dat het voorkeur geven aan één personage zou kunnen leiden tot ontbrekende belangrijke plotpunten of gameplay. Creatief directeur Jonathan Dumont ging over deze zorgen en beschreef zijn eigen evenwichtige aanpak: "Ik ben de neiging om redelijk gelijkmatig te schakelen tussen personages. Ik kan bijvoorbeeld 3-5 uur met één hoofdrolspeler doorbrengen, dan nog eens 2-3 uur met de tweede."
Dumont verzekerde spelers echter dat het kiezen van een hoofdpersoon hun ervaring niet significant zal belemmeren. Terwijl elke hoofdrolspeler unieke inleidende sequenties en persoonlijke verhaallijnen beschikt, past het verhaal van de game zich aan aan de voorkeur van de speler. Hij moedigt spelers aan om te spelen zoals ze willen: "Ik geloof niet dat je veel zult missen. Het komt echt neer op je persoonlijke speelstijl. Je denkt misschien: 'Oké, ik zal zien hoe de game aanpast op basis van welk personage ik kies.' Elke held heeft zijn eigen unieke introducties en speciale questlines, maar de kernervaring is flexibel.
